ΕΡΓΑΣΤΗΡΙΟ ΕΦΑΡΜΟΣΜΕΝΗΣ ΓΕΝΕΤΙΚΗΣ & ΓΕΝΕΤΙΚΗΣ ΒΕΛΤΙΩΣΗΣ ΙΧΘΥΩΝ, ΤΜΗΜΑ ΖΩΙΚΗΣ ΠΑΡΑΓΩΓΗΣ ΑΛΙΕΙΑΣ ΚΑΙ ΥΔΑΤΟΚΑΛΛΙΕΡΓΕΙΩΝ

Τα ερευνητικά ενδιαφέροντα της ερευνητικής ομάδας του Τμήματος Τεχνολογίας Αλιείας-Υδατοκαλλιεργειών του Τ.Ε.Ι. Δυτικής Ελλάδας εστιάζονται στην Εφαρμοσμένη Πληθυσμιακή Γενετική Υδρόβιων Οργανισμών με δυο κύριες κατευθύνσεις: (α) την Ποσοτική Γενετική & Γενετική Βελτίωση Ιχθύων και (β) την Πληθυσμιακή Γενετική Δομής & Διατήρησης πληθυσμών υδρόβιων ειδών με έμφαση στα οικοσυστήματα λιμνοθαλασσών. Το εργαστήριο είναι το μόνο στον Ακαδημαϊκό χώρο που αποδεδειγμένα έχει την ευθύνη της οργάνωσης και εφαρμογής μακρόχρονων και αυτοχρηματοδοτούμενων προγραμμάτων γενετικής βελτίωσης επιχειρήσεων του ιδιωτικού τομέα (3 εταιρειών Α.Ε. για 15 χρόνια), σε Ελλάδα και Τουρκία, γεγονός που καταδεικνύει την ευρεία αναγνώριση της αποτελεσματικής εφαρμογής της επιστημονικής γνώσης στην παραγωγή. Από την άλλη, έχει αναπτύξει σημαντικές συνεργασίες με ερευνητικές ομάδες του εσωτερικού και του εξωτερικού, στο πλαίσιο εθνικών και ευρωπαϊκών ερευνητικών προγραμμάτων όπως φαίνεται παρακάτω.

Σε ότι αφορά την Γενετική Βελτίωση έμφαση δίνεται στην:

• Γενετική ανάλυση των κύριων οικονομικά ενδιαφερόντων ποσοτικών χαρακτήρων που είναι στόχοι βελτίωσης (αύξηση, ποιότητα σάρκας, ποσοστό λίπους, ανθεκτικότητα σε ασθένειες),
• Η εκτίμηση γενετικών και περιβαλλοντικών συνιστωσών διακυμάνσεων και εκτίμηση της μεταξύ τους αλληλεπίδρασης (GxE).
• Σχεδιασμός προγραμμάτων Γενετικής Βελτίωσης, και γενετική αξιολόγηση γεννητόρων (π.χ. marker-assisted selection και εκτίμηση κληροδοτικών τιμών).
• Σχεδιασμός και εκτέλεση γονιδιωματική ανάλυσης (π.χ. συσχέτιση μεταξύ φαινοτύπων και γενετικών σημαντών – QTL ανάλυση)

Σε ότι αφορά την Πληθυσμιακή Γενετική Δομής & Διατήρησης πληθυσμών υδρόβιων ειδών έμφαση δίνεται στην:

• Εφαρμογή μοριακών και φαινοτυπικών σημαντών (markers) για την διερεύνηση πληθυσμιακής διαφοροποίησης και της συνδεσιμότητας (connectivity) των πληθυσμών των θαλάσσιων ειδών
• Προσδιορισμό διακριτών πληθυσμών ως διαχειριστικές μονάδες και η βιώσιμη γενετική διαχείριση τους.
• Επίδραση βιοτικών και αβιοτικών παραγόντων στην πληθυσμιακή δομή και γονιδιακή ροή, με έμφαση στα λιμνοθαλάσσια οικοσυστήματα.

Ερευνητικά προγράμματα σχετικά με το αντικείμενο της πρότασης

<aside> 💡 Προσδιορισμός της βέλτιστης μορφολογίας της τσιπούρας, ανάπτυξη σύγχρονων μορφομετρικών εργαλείων και έλεγχος της γενετικής τους βάσης για την ενσωμάτωση του σχήματος σε προγράμματα γενετικής βελτίωσης. ΕΠΑΛ 2007-2013 (1455/25-7-2014, Μέτρο 3.5). (2014-2015)

</aside>

<aside> 💡 Εκτίμηση γενετικών παραμέτρων και ανίχνευση γενετικών τόπων ποσοτικών ιδιοτήτων (QTL) για οικονομικά σημαντικούς χαρακτήρες σε καλλιεργούμενους πληθυσμούς τσιπούρας ΑΡΧΙΜΗΔΗΣ ΙΙΙ - ΕΠΕΔΒΜ με κωδικό MIS 383566. (2012 – 2014)

</aside>

<aside> 💡 Ανάπτυξη καινοτόμων μεθόδων και μοριακών εργαλείων για τον έλεγχο και τη βελτίωση της ποιότητας των εκτρεφόμενων πληθυσμών τσιπούρας και λαβρακιού. Συνεργασία 2009, ΕΣΠΑ 2007-2013 (ΓΓΕΤ). (2010-2013)

</aside>

<aside> 💡 Combined genetic and functional genomic approaches for stress and disease resistance marker assisted selection in fish and shellfish (Acronym: AQUAFIRST - STREP 513692) Επιστημονικός Υπεύθυνος για την εταιρεία ΝΗΡΕΥΣ Α.Ε. (2004-2007)

</aside>

<aside> 💡 Tools for the genetic improvement of sea bass. Construction and preliminary application of a medium density linkage and synteny map (BASSMAP - Quality of Life, QLRT-2000-01701). (Leader WP11). (2001 – 2005)

</aside>

<aside> 💡 Bridging genomes: An integrated genomic approach toward genetic improvement of aquacultured fish species (BRIDGEMAP - Quality of Life, QLRT-2000-01797). (Leader WP6). (2001 – 2005)

</aside>

Δημοσιεύσεις σχετικές με το αντικείμενο της πρότασης

Fragkoulis, S., Christou, M., Karo, R., Ritas, C., Tzokas, C., Batargias, C., Koumoundouros, G., 2017. Scaling of body-shape quality in reared gilthead seabream Sparus aurata L. Consumer preference assessment, wild standard and variability in reared phenotype. Aquac. Res. doi:10.1111/are.13076